Config.Retenciones
Para hacer la configuración de la retenciones solo debes ir a la opción Administrador > Parametrizar cuentas
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ahí buscas la pestaña que dice retención.
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luego vas a configurar la retención deseada para que tenga el porcentaje correcto y sea contabilizada según lo que usted desea, luego de configurar aplastas en guardar y listo la configuración de la retención quedaría guardada.